Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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