Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA5

Krr1, KRR1 small subunit processome component homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krr1Q8BGA5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krr1Q8BGA5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krr1Q8BGA5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms