Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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