Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc50Q810U5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms