Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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NanogQ80Z64 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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NanogQ80Z64 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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NanogQ80Z64 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NanogQ80Z64 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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