Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ell3Q80VR2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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