Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc29Q80VM3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc29Q80VM3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc29Q80VM3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc29Q80VM3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ttc29Q80VM3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ttc29Q80VM3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ttc29Q80VM3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ttc29Q80VM3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ttc29Q80VM3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ttc29Q80VM3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ttc29Q80VM3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ttc29Q80VM3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ttc29Q80VM3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ttc29Q80VM3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttc29Q80VM3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ttc29Q80VM3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc29Q80VM3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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