Protein–RNA interactions for Protein: Q80U58

Pum2, Pumilio homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum2Q80U58 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pum2Q80U58 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pum2Q80U58 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms