Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2q1Q7TSS2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2q1Q7TSS2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms