Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdp1Q7TSG2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdp1Q7TSG2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms