Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms