Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actn1Q7TPR4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actn1Q7TPR4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms