Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nphp3Q7TNH6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms