Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Z0

Rtn4rl2, Reticulon-4 receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rl2Q7M6Z0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms