Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ScocQ78YZ6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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