Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcl2Q78Y63 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcl2Q78Y63 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms