Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sys1Q78S06 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sys1Q78S06 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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