Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ubfd1Q78JW9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ubfd1Q78JW9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ubfd1Q78JW9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubfd1Q78JW9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ubfd1Q78JW9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ubfd1Q78JW9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ubfd1Q78JW9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms