Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2r2Q6ZWZ2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms