Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih3Q6ZWS4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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