Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NinlQ6ZQ12 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NinlQ6ZQ12 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms