Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja6Q6S5G4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gja6Q6S5G4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms