Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE7

Slc6a7, Sodium-dependent proline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a7Q6PGE7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc6a7Q6PGE7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a7Q6PGE7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms