Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf316Q6PGE4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf316Q6PGE4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms