Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HjurpQ6PG16 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HjurpQ6PG16 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms