Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herc4Q6PAV2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms