Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gga2Q6P5E6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gga2Q6P5E6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gga2Q6P5E6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gga2Q6P5E6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gga2Q6P5E6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gga2Q6P5E6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gga2Q6P5E6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gga2Q6P5E6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms