Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp200Q6P4T2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms