Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rprd2Q6NXI6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rprd2Q6NXI6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms