Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms