Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm4Q6IRU2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm4Q6IRU2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms