Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
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Ptpn13Q64512 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
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Ptpn13Q64512 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptpn13Q64512 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Ptpn13Q64512 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Ptpn13Q64512 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptpn13Q64512 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptpn13Q64512 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ptpn13Q64512 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn13Q64512 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ptpn13Q64512 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ptpn13Q64512 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn13Q64512 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn13Q64512 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ptpn13Q64512 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ptpn13Q64512 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Ptpn13Q64512 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Ptpn13Q64512 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ptpn13Q64512 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms