Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim24Q64127 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim24Q64127 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms