Protein–RNA interactions for Protein: Q63959

Kcnc3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc3Q63959 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Kcnc3Q63959 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc3Q63959 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms