Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CcncQ62447 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcncQ62447 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcncQ62447 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcncQ62447 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms