Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms