Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ss18Q62280 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ss18Q62280 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Ss18Q62280 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ss18Q62280 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ss18Q62280 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ss18Q62280 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ss18Q62280 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ss18Q62280 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ss18Q62280 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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