Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sycp1Q62209 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms