Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd180Q62192 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms