Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms