Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AtrxQ61687 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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AtrxQ61687 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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AtrxQ61687 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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AtrxQ61687 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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