Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifi47Q61635 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifi47Q61635 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifi47Q61635 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifi47Q61635 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifi47Q61635 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifi47Q61635 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifi47Q61635 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifi47Q61635 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifi47Q61635 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifi47Q61635 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifi47Q61635 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifi47Q61635 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms