Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itm2aQ61500 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itm2aQ61500 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itm2aQ61500 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itm2aQ61500 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms