Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccne1Q61457 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccne1Q61457 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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