Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc6Q61143 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms