Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Laptm4aQ60961 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Laptm4aQ60961 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms