Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms