Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc85aQ5SP85 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc85aQ5SP85 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms