Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh12Q5RJH3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms