Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt35Q497I4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt35Q497I4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms